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Im Jahr 1956 beauftragte Zielke den [[Ältester|Ältesten]] Petersen von der südafrikanischen Schwesterkirche, der [[Apostolic Church of South-Africa - Apostle Unity|Apostolic Church of South Africa]], sich mit Apostel [[Philippus Jacobus Erasmus]] und Apostel [[Daniel Carel Smuts Malan]] zu treffen, die sich aufgrund der [[Botschaft]] des [[Stammapostel]]s [[Johann Gottfried Bischoff]]s von der [[Neuapostolische Kirche|Neuapostolischen Kirche]] getrennt hatten. Am 23. November 1956 wurde in Kapstadt eine Übereinkunft über den Zusammenschluss erzielt und die [[Apostolic Church of South-Africa - Apostle Unity]] gegründet.

Nach etwa einjähriger Krankheit verstarb Emil Zielke am 13. März 1962 im General Hospital der Stadt Bundaberg. Die Trauerfeier fand in Hatton Vale statt und wurde von seinen beiden Amtsnachfolgern, seinem Sohn Arnold Zielke und Arnan Niemeyer gehalten. Die Bischöfe E. G. Flor aus Mackay und H. Niemeyer aus Hatton Vale waren ebenfalls anwesend.